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客戶發表文章簡介--微生物領域
作者: 來源: 發布于:2016-5-23 15:43:10 點擊量:

細菌基因組測序
長雙歧桿菌通過適應性進化增強耐酸性:耐酸突變體和野生型的基因比較分析 (合作發表)
Jiang Y, Ren F, Liu S, et al. Enhanced Acid Tolerance in Bifidobacterium longum by Adaptive Evolution: Comparison of the genes between the acid-resistant variant and wild-type strain[J]. Journal of microbiology andbiotechnology, 2015.
酸脅迫是對長雙岐桿菌具有嚴重破壞性質的環境壓力。為了利用自適應進化學方法提高長雙歧桿菌BBMN68菌株的耐酸性,研究人員在一定條件下對BBMN68菌株進行培養,從5個時間點獲得的克隆株中分離耐酸突變體,利用基因組測序技術并結合表型分析對BBMN68耐酸突變菌株和野生菌株的表型和基因組差異進行研究,同時利用qRT-PCR技術檢測EPS合成關鍵基因cpsD的表達情況。結果分析表明, BBMN68菌株的耐酸性提高, 突變菌株中鑒定出19SNPs,其中6個基因的氨基酸序列發生了改變,而 EPS的變化可能是BBMN68m耐酸性的關鍵因素。上述結果為揭示長雙歧桿菌耐酸的可能性機制提供了研究依據。

 

16S測序
從玉米中分離出攜帶nifH基因的類芽孢桿菌新種 (合作發表)
Gao J, Lv F, Wang X, et al. Paenibacillus wenxiniae sp. nov., a nifH gene-harbouring endophytic bacterium isolated from maize[J]. Antonie van Leeuwenhoek, 2015, 108(5): 1015-1022.
  類芽孢桿菌屬隸屬于類芽孢桿菌科,到目前為止,該屬已正式命名的種有150個之多。它們可生存的環境很多,比如空氣、堿性土、發酵物、濕地、溫泉、沉積物、根瘤等。在調查研究玉米內生固氮菌多樣性的過程中,我們發現了類芽孢桿菌屬的一個新種,暫命名為373 T。研究人員采集玉米抽雄期根部組織,在缺氮培養基上培養分離373 T菌株(P. hunanensis DSM 22170T 菌株為對照),隨后利用16S測序技術進行分析。基于數據分析,研究人員構建了373 T及其近緣種的系統進化樹,并對nifH基因序列進行了系統進化分析; 確定373T菌種是類芽孢桿菌屬近緣種的表型分化,目前已被提議定名為Paenibacillus wenxiniae sp. nov.



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