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SNP芯片

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Affymetrix SNP芯片

產品描述信息

  單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism, SNP) 是在單個的核苷酸上發生變異而引起的DNA序列多態性,多為轉換和顛換兩種。SNP作為第三代遺傳標記,數量眾多、分布廣泛、易于檢測,是理想的基因分型目標。SNP分型檢測在疾病基因組、遺傳育種、群體進化、藥物基因組學、診斷學、生物醫藥研究等領域具有重大意義。

 

  基于Affymetrix 公司GeneChip和GeneTitan平臺的全基因組SNP芯片既可用于全基因組SNP分析,又可用于CNV分析。

產品詳細信息

 

 

 

基于GeneChip平臺的人SNP 6.0 芯片的實驗流程

 

 

 

芯片推薦

芯片名稱

物種

SNP位點數

應用

Genome-Wide Human SNP

906,600

(1)全基因組關聯研究(GWAS)

Axiom®CHB1& CHB2

中國人

130

(1)最大限度覆蓋稀有和常見變異,專為中國人群設計

Axiom® Exome

35,000

(1)最完整的外顯子組基因分型芯片,可篩查功能變異,了解疾病相關性

Axiom® Porcine

658,692

(1)高分辨率遺傳圖譜的構建

(2)純系的遺傳改良

(3)數量性狀位點(QTL)的精細定位

(4)訓練群體的開發,利用基因組選擇模型計算育種值

Axiom® Buffalo

水牛

90,000

分子育種

復雜性狀研究

保護生物多樣性

Axiom® BOS1

>640,000

(1)全基因組關聯研究(GWAS)

(2)生物多樣性

(3)連鎖不平衡(LD)研究

Axiom® Chicken

580,961

(1)蛋雞和肉雞育種價值的預測

(2)全基因組關聯研究

(3)高分辨率遺傳作圖和孟德爾性狀作圖

(4)選擇特征分析

Axiom® equine

>670,000

(1)全基因組關聯研究

(2)高分辨率遺傳作圖和孟德爾性狀作圖

(3)多樣性分析和選擇特征分析

Axiom® Salmon

鮭魚/三文魚

>130,000

(1)復雜性狀研究:GWASQTL精細定位研究

(2)分子育種:關聯作圖和性別鑒定等

(3)群體與進化遺傳學:區分不同產地的魚類品種以及區分養殖和野生種群

Axiom® Trout

虹鱒魚

57,501

(1)復雜性狀研究和分子育種:GWAS和數量性狀位點(QTL)作圖、重要經濟性狀的鑒定、通過基因組選擇改善水產養殖育種計劃的準確性

(2)群體和進化遺傳學:區分不同來源的魚類、性別鑒定、區分養殖和野生的群體

Axiom® Maize

玉米

609,442 SNP和6,759 個插入/缺失

(1)復雜性狀的研究:遺傳多樣性分析、關聯作圖全基因組分析和選擇、玉米多樣性的單倍型研究、LD分析和QTL精細作圖

(2)分子育種:開發新的品系和基因組選擇

Axiom® Wheat reeder

小麥

817,000

(1)分子育種--優質小麥品系培育:基因組選擇、標記輔助選擇、滲入基因(Introgressed genes)的檢測、種質資源鑒定和高通量篩選

Axiom® Wheat HD

小麥

817,000

(1)全球六倍體小麥品系

(2)復雜性狀研究

Axiom® Cotton

棉花

35,550

(1)復雜性狀研究:開展GWAS和精細作圖和鑒定有經濟意義的性狀

(2)分子育種:開展關聯作圖、提高育種計劃的效率和培育棉花的新品種

Axiom® Soybean

大豆

180,961

(1)基因組結構和復雜性狀研究:開展GWAS和精細作圖、確定具有經濟價值的性狀、構建高分辨率的遺傳圖譜和檢測基因組結構的自然變異

(2)分子育種:在大豆育種項目中開展關聯定位和基因組選擇

(3)群體和進化遺傳學:區分不同來源的大豆群體、 區分栽培種和野生種的群體

Axiom® Strawberry

草莓

95,062

(1)復雜性狀的研究:QTL發現以及鑒定具有經濟價值的性狀

(2)分子育種:全基因組掃描、分子標記輔助育種

(3)新品種的發布:加快和提高品種開發的效率、鑒定現有的草莓種質資源中存在的重要標記、利用遺傳信息來確定將在特定種植區表現良好的種質

Axiom® Rose

玫瑰

68,893

(1)復雜性狀研究:多倍體連鎖圖譜、后代和育種材料中多個SNP單倍型的鑒定、用于發現與重要表型性狀(如抗病能力)相關聯的標記單倍型的QTL分析

(2)分子育種:單倍型輔助選擇和雜交親本的單倍型選擇、加速和提高品種開發的效率


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